Beste kostenlose Molecular Modeling-Software für Windows 10
In diesem Artikel behandeln wir die beste kostenlose Molecular Modeling-Software für Windows 10 - PCs. Mit dieser Freeware können Sie Modelle verschiedener einfacher bis komplexer chemischer Verbindungen erstellen. Diese Softwaresammlung ist hilfreich für Studenten der Bioinformatik, Chemieingenieurwesen usw. Sie können verschiedene Elemente aus dem Periodensystem(Periodic Table) hinzufügen , um eine chemische Verbindung zu bilden. Darüber hinaus können Sie in dieser Software auch eine chemische Verbindung in verschiedenen Stilen anzeigen, wie Drahtmodell, Kugel und Stab, Rohre, Kugel und Zylinder(wireframe, ball and stick, pipes, ball and cylinder) und mehr.
Molecular Modeling -Software für Windows 10
Einige dieser Software enthalten auch verschiedene chemische Gruppen und Strukturen für Ihre Bequemlichkeit. Wählen Sie sie einfach(Simply) aus, und Ihr chemisches Modell ist fertig. Beispiele für chemische Gruppen sind Alkohole, Benzol, Aldehyde, Aminosäuren(alcohols, benzene, aldehydes, amino acids) usw. Abgesehen davon können Sie auch chemische Berechnungen wie Energie, Bindungslänge(energy, bond length) usw. durchführen.
- Avogadro
- MoluCAD
- ArgusLab
- Ascalaph-Designer
Werfen wir einen Blick auf sie.
1] Avogadro
Avogadro ist eine ausgezeichnete Freeware für molekulare Modellierung, die mit zahlreichen Funktionen ausgestattet ist. Seine benutzerfreundliche Oberfläche macht es für die Benutzer leicht verständlich. Beim Starten der Software sehen Sie einen schwarzen Bildschirm und ein Bedienfeld auf der linken Seite. Sie können auf einige häufig verwendete Elemente über das „ Dropdown-Menü(drop-down menu) “ auf der linken Seite zugreifen. Wenn Sie auf alle Elemente zugreifen möchten, klicken Sie einfach im Dropdown-Menü auf „ Andere(other) “ und die Software startet das Periodensystem(Periodic Table) . Das Element, das Sie aus dem Periodensystem(Periodic Table) auswählen , wird in der Dropdown-Liste verfügbar sein.
Schritte zum Zeichnen einer chemischen Verbindung:
- Wählen Sie(Select) ein Element aus dem Dropdown-Menü im linken Bereich aus und klicken Sie auf den schwarzen Bildschirm, um es hinzuzufügen.
- Wählen Sie nun ein anderes Element aus dem Dropdown-Menü aus.
- Halten Sie die linke Maustaste gedrückt und ziehen Sie sie auf das erste Element, um es mit einer chemischen Bindung zu verbinden. Sie können auch die Art der chemischen Bindung auswählen, einfach, doppelt oder dreifach.
In der Symbolleiste der Software gibt es verschiedene Schaltflächen:
- Zeichenwerkzeug(Draw tool) : Damit können Sie verschiedene molekulare Verbindungen zeichnen.
- Navigationswerkzeug(Navigation tool) : Mit ihm können Sie das Molekülmodell verschieben, drehen, vergrößern und verkleinern.
- Bindungszentrisches Manipulationswerkzeug(Bond centric manipulation tool) : Wählen Sie dieses Werkzeug und klicken Sie auf eine der Bindungen, um den Winkel anzuzeigen.
- Automatisches Rotationswerkzeug(Auto rotation tool) : Wählen Sie dieses Werkzeug aus und klicken Sie auf die Schaltfläche „ Start “. Halten Sie nun die linke Maustaste gedrückt und ziehen Sie sie in eine beliebige Richtung. Lassen Sie die linke Maustaste los und das Molekularmodell beginnt sich automatisch zu drehen.
Wenn Sie die Bindungslänge von Verbindungen automatisch anpassen möchten, gehen Sie zu „ Extensions > Optimize Geometry “ oder drücken Sie „ Ctrl+Alt+O “. Um die Energie zu berechnen, gehen Sie zu „ Extensions > Molecular Mechanics > Calculate Energy “.
Speichern der Datei(Saving the File) : Sie können Ihr Projekt in mehreren Formaten speichern, darunter PDB, ENT, CHM, ALC, CDXML, CDX, C3D2, C3D1, SD, SDF, DMOL, CHT, GAM . Außerdem steht eine Exportoption zur Verfügung, mit der Sie Ihr Projekt in PDF, SVG, BMP, JPG, PNG usw. speichern können.
2] MoluCAD
MoluCAD ist eine weitere kostenlose Freeware für molekulare Modellierung in dieser Liste. Wie Avogadro verfügt es auch über viele Funktionen. In dieser Software können Sie sowohl 2D- als auch 3D-Ansichten nebeneinander anzeigen. Einige häufig verwendete Elemente sind auf der linken Seite der Software verfügbar. Um es dem Hauptbereich hinzuzufügen, klicken Sie einfach auf eines der Elemente. Wenn das Element, das Sie hinzufügen möchten, dort nicht verfügbar ist, können Sie es aus dem Periodensystem(Periodic Table) auswählen . Um das Periodensystem(Periodic Table) anzuzeigen , klicken Sie mit der rechten Maustaste auf das schwarze Feld und klicken Sie auf die Schaltfläche „ Atom hinzufügen(Add Atom) “.
Schritte zum Zeichnen einer chemischen Verbindung:
- Klicken Sie(Click) auf eines der Elemente im linken Bereich, um es hinzuzufügen.
- Klicken Sie(Click) auf ein anderes Element, um es hinzuzufügen, oder wählen Sie es aus dem Periodensystem(Periodic Table) aus .
- Um die Elemente zu verbinden, gehen Sie zu „ Add > Bonds – Connect Atoms “ und wählen Sie die Art der chemischen Bindung aus. Klicken Sie nun auf das erste Atom und dann auf das zweite.
Neben Elementen können Sie auch Verbindungen hinzufügen. Auf der rechten Seite finden Sie verschiedene Moleküle, Aminosäuren, funktionelle Gruppen, Einzelpaaratome(molecules, amino acids, functional groups, lone pair atoms) usw. Wählen Sie eine beliebige Struktur aus und ziehen Sie sie per Drag & Drop in den Hauptbereich. Sie können die Energie der Moleküle berechnen, indem Sie auf „ Energy > Evaluate Energy “ klicken.
Mit dem Menü „ Abfrage “ können Sie den (Query)Abstand zwischen zwei Atomen, die Bindungslänge, den Bindungswinkel, den Torsionswinkel, den Massenmittelpunkt(distance between two atoms, bond length, bond angle, torsion angle, the centre of mass) usw. berechnen . Sie können die 3D-Struktur in vier verschiedenen Ansichten anzeigen, von oben, von vorne, von der Seite und schräg(top, front, side, and oblique) . Gehen Sie zu „ View > Graphics Mode “, um das Modell in verschiedenen Formen anzuzeigen, wie Ball & Stick, Raumfüllung, Rohre(ball & stick, space fill, pipes) und mehr.
Speichern der Datei(Saving the file) : Sie können das Projekt im MCD -Format speichern. Wenn Sie die Option „ Exportieren “ im Menü „ (Export)Datei(File) “ verwenden, können Sie Ihr Projekt in den Formaten JPEG und Windows BITMAP speichern.
3] ArgusLab
ArgusLab ist eine weitere benutzerfreundliche molekulare Modellierungssoftware mit leicht verständlichen Funktionen. Mit dieser Software können Sie die Struktur verschiedener chemischer Verbindungen erstellen. Auf der linken Seite der Software sind drei Registerkarten verfügbar:
- Atome(Atoms) : Diese Registerkarte enthält verschiedene Elemente des Periodensystems(Periodic Table) . Beim Anklicken jedes Atoms zeigt die Software seine Geometrie an. Klicken Sie(Click) auf die Schaltfläche „ Periodensystem “, um das (Periodic Table)Periodensystem(Periodic Table) zu starten .
- Ringe(Rings) : Hier erhalten Sie verschiedene Arten von chemischen Ringstrukturen.
- Aminosäuren(Amino Acids) : Diese Registerkarte zeigt verschiedene Arten von Aminosäuren. Auf dieser Registerkarte ist auch „ Polypeptide Builder “ verfügbar.
Schritte zum Zeichnen einer chemischen Verbindung:
- Klicken Sie im linken Bereich auf die Registerkarte „ Atom “, um ein Element hinzuzufügen.
- Wählen Sie(Select) eines der verfügbaren Elemente aus. Wenn Ihr gewünschtes Element nicht vorhanden ist, können Sie dasselbe aus dem „ Periodensystem(Periodic Table) “ auswählen.
- Mit(Use) der rechten Maustaste platzieren Sie das Element auf dem dafür vorgesehenen Platz.
- Wählen Sie(Select) ein anderes Element aus. Wählen Sie nun das letzte Element mit der linken Maustaste aus und platzieren Sie das andere Element mit der rechten Maustaste. Dies verbindet die beiden Elemente und bildet eine Verbindung.
- Befolgen Sie die gleichen Schritte, um Ringe und Aminosäuren in den Zwischenraum einzufügen.
4] Ascalaph-Designer
Ascalaph Designer ist eine weitere gute Freeware für molekulare Modellierung. Das Beste an der Software ist, dass Sie sie nicht auf Ihrem PC installieren müssen. Es wird mit einer ausführbaren Datei geliefert. Die Software wird im ZIP-Format heruntergeladen. Nach dem Extrahieren finden Sie die ausführbare Datei im Ordner „ bin “.
Schritte zum Zeichnen einer chemischen Verbindung:
- Drücken Sie „ Ctrl+N “, um ein neues Projekt zu starten.
- Um Elemente hinzuzufügen, müssen Sie das Periodensystem(Periodic Table) öffnen . Gehen Sie dazu zu „ Build > Free Drawing “.
- Wählen Sie(Select) eines der Elemente aus und platzieren Sie es im Raum, indem Sie die Tasten „ Ctrl+Shift “ drücken.
- Platzieren Sie ein weiteres Element mit dem obigen Schritt und ziehen Sie es zum letzten Element, um es mit einer chemischen Bindung zu verbinden.
Sie können jede Verbindung in verschiedenen Formen wie Ball and Stick, Wireframe, CPK usw. anzeigen, indem Sie auf die Schaltflächen auf der rechten Seite klicken. Wenn Sie ein beliebiges Element aus dem Periodensystem(Periodic Table) auswählen , werden Ihnen zusätzliche Informationen wie Elementname, Hybridisierung, Kovalenz und Van-der-Waals-Anziehungskräfte angezeigt(element name, hybridization, covalent, and Van Der Waals forces of attraction) . Klicken Sie auf das Menü „ Analysieren(Analyze) “, um verschiedene Berechnungen durchzuführen, einschließlich Energie, Temperatur, Druck, Dipolmoment(energy, temperature, pressure, dipole moment) usw.
Speichern der Datei(Saving the file) : Sie können Ihr Projekt nur in seinen eigenen Formaten speichern, einschließlich mim, hin, xmol , mmol, smol usw. Dies ist der Nachteil dieser Freeware.
Wir hoffen, dass Sie diesen Beitrag für Ihre Schul- und Hochschulprojekte nützlich fanden.
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